O CAUP funciona como Instituição de Acolhimento para projectos de Programa Doutoral em Astronomia da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto sob orientação ou co-orientação de investigadores do CAUP (ver regulamento dos alunos de doutoramento).

Dispondo do maior grupo de doutorados em Astronomia do País, o CAUP oferece condições únicas em termos de espaço, equipamento, biblioteca e acesso a infra-estruturas internacionais de observação (a partir do solo e do espaço) essenciais para o desenvolvimento de um projecto de doutoramento.

Os alunos de doutoramento serãointegrados nos diferentes projectos de investigação em curso ou em colaboração com instituições de investigação em Astronomia com quem o CAUP mantém relações privilegiadas.

O CAUP, como Instituição de Acolhimento, apoia as candidaturas a Bolsas de Doutoramento no âmbito do Programa de Formação Avançada da Fundação para a Ciência e a Tecnologia e de outros programas europeus em curso.